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科研工具箱:重组蛋白表达之密码子优化
Optimization of Codon Translation for Recombinant Protein Expression
蛋白质序列
选择优化的物种:

密码子优化
密码子优化工具使用说明:
这份使用说明将帮助您了解如何使用密码子优化工具来对蛋白质氨基酸序列进行密码子优化,并确保优化后的DNA序列的GC含量在指定的范围内。请按照以下步骤操作:
步骤 1:输入氨基酸序列
1.在页面上找到名为“请输入蛋白质的氨基酸序列”的文本框
2.在文本框中输入您要进行密码子优化的氨基酸序列。注意,输入的序列应为字母 A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Y 的组合。
步骤 2:选择优化的物种
1.在页面上找到名为“选择优化的物种”的一组单选按钮。
2.工具将根据您选择的物种和氨基酸序列,使用优先的密码子进行优化,确保生成的DNA序列的GC含量在规定范围内。
步骤 3:查看优化结果
1.在页面上会显示优化后的结果。
2.您可以查看优化后的DNA序列和相应的GC含量。确保GC含量在45%至58%之间。
注意事项:
1.输入的氨基酸序列应为合法的氨基酸字母(A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Y)组合。
2.优化过程可能会进行多次迭代,以确保生成的DNA序列的GC含量在规定范围内。
3.工具会首先尝试使用每个氨基酸的首选密码子来优化序列。如果GC含量不在范围内,则可能会随机选择部分密码子来进一步优化序列。
4.请注意,密码子优化过程是随机的,因此每次优化的结果可能会有所不同。
5.在密码子优化过程中,确保选择适当的物种以匹配您的实验要求。
6.GC含量是生成的DNA序列中的鸟嘌呤和胞嘧啶的百分比。优化结果的GC含量应在42%至58%之间,以确保最佳的生物学兼容性。
希望这份使用说明对您理解密码子优化工具的操作和注意事项有所帮助。如果您遇到任何问题或疑问,请随时与我们联系。
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